轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及分析
1.表達(dá)譜檢測(cè)分析
表達(dá)譜測(cè)序是直接針對(duì)特定物種或特定細(xì)胞在某一狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來(lái)的所有mRNA進(jìn)行高通量測(cè)序,用來(lái)研究mRNA基因的表達(dá)定量和差異情況。表達(dá)譜測(cè)序要求讀長(zhǎng)短,所需測(cè)序量小,可準(zhǔn)確檢測(cè)低豐度基因轉(zhuǎn)錄本,具有定量準(zhǔn)、可重復(fù)性高、檢測(cè)閾值寬、成本低等特點(diǎn)。本公司具有穩(wěn)定的測(cè)序建庫(kù)實(shí)驗(yàn)流程與系統(tǒng)的生物信息分析手段,能夠?yàn)榭蛻籼峁┥疃葌€(gè)性化的模式動(dòng)植物的數(shù)字基因表達(dá)譜測(cè)序服務(wù),為客戶從基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控視角解析疾病機(jī)制、生理發(fā)育、腫瘤、藥物篩選、農(nóng)業(yè)性狀、生物標(biāo)記等問(wèn)題,提供切實(shí)可行的研究方案和專業(yè)的技術(shù)支持。
圖:表達(dá)譜檢測(cè)分析樣品聚類和差異基因功能富集示例
2.有參轉(zhuǎn)錄組檢測(cè)與生信分析
基于有參考基因組物種的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,能檢測(cè)某一物種或特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下產(chǎn)生的mRNA表達(dá)水平,并解析基因結(jié)構(gòu)差異,發(fā)現(xiàn)稀有新轉(zhuǎn)錄本,精確地識(shí)別可變剪切位點(diǎn)、基因融合等。目前已廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)研究、臨床診斷、藥物研發(fā)和分子育種等領(lǐng)域。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)從基因可變剪切調(diào)控、融合基因功能異常等視角為客戶提供更精準(zhǔn)更深層的轉(zhuǎn)錄信息為疾病機(jī)制、生理發(fā)育、腫瘤、藥物篩選、農(nóng)業(yè)性狀、生物標(biāo)記等問(wèn)題提供全新的思路。
圖:轉(zhuǎn)錄組分析解析可變剪切分類數(shù)量與特征基因不同剪切體結(jié)構(gòu)域特征